到这季开始时，X档案已是家喻户晓的科幻影集了。虽然仍被某些人认为太过偏激，但在金球奖艾美奖纷纷获得肯定。第四季仍是过去一贯的风格，但加入了许多穆德、史考莉的个人生活。在该季中，“黑油”“天花蜂”的出现使有关“真相”的调查变得更加坎坷而且扑朔迷离。另外一重大发展则是史考莉发现自己患有癌症，住院治疗，病情虽稳定住，但仍有危险。本季也介绍癌人的年轻时代，向观众交待他的历史。本季也包括了一集喜剧。本季结束于穆德在从阿拉斯加调查回来后对生命绝望，因而举枪自杀。
凯伦·吉兰 艾瑞丝·阿帕托 莱斯利·曼恩 大卫·杜楚尼 佩德罗·帕斯
大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 米彻·佩勒吉 雷蒙德·J·巴里 威廉·B·戴维
大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 米彻·佩勒吉 汤姆·布莱德伍德 威廉·B·戴维
大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 米彻·佩勒吉 威廉·B·戴维斯 汤姆·布莱德伍
吉莲·安德森 凯莉·霍威 比莉·派佩 卢夫斯·塞维尔 萝玛拉·嘉瑞
海伦·米伦 吉莲·安德森 奥利维亚·罗斯 布莱斯·吉扎尔 帕齐·费
大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 罗伯特·帕特里克 米彻·佩勒吉 小詹姆斯·皮肯
杰西卡·贝尔 威廉·B·戴维斯 祖蒂·弗兰 史蒂芬·麦克哈蒂
大卫·杜楚尼 吉莲·安德森 威廉·B·戴维斯 克里斯·欧文斯 米彻·佩勒
特罗伊安·艾夫瑞·贝利萨里奥 布兰登·拉瑞昆特
未知
蒂姆·罗斯 凯利·威廉姆斯 布伦丹·海因斯 莫妮卡·雷蒙德 哈蕾·麦克法
查理·辛 乔恩·克莱尔 安加斯·T·琼斯 乔迪·琳·欧基菲 朱丽娅·坎贝
布里奇特·埃弗里特 杰夫·西勒 玛丽·凯瑟琳·歌瑞森 蒂姆·巴格来 莫瑞·希
查理·考克斯 黛博拉·安·霍尔 埃尔登·汉森 文森特·多诺费奥 威尔逊·贝索
迪昂·史密斯 CharlesBrice CharlesAmbrose SkylarEbron KevinHowell
UnitedStatesMen'sNationalBasketBallTeam
戴安娜·戈麦斯 SandraMartín
瑞恩·卡特赖特 大卫·斯特雷泽恩 马利克·约巴 沃伦·克里斯蒂 劳拉·门内
佩德罗·阿隆索 纳瓦·尼姆利 米歇尔·珍娜 伊西娅尔·伊图诺 胡利奥·佩
演员：特罗伊安·艾夫瑞·贝利萨里奥 布兰登·拉瑞昆特
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演员：
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演员：蒂姆·罗斯 凯利·威廉姆斯 布伦丹·海因斯 莫妮卡·雷蒙德 哈蕾·麦克法
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